<!DOCTYPE html>
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    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    <p>Hi Dmitry,</p>
    <p><br>
    </p>
    <p>if your model is composed of chains related by some
      rotation/translation (does not matter what symmetry), you can ask
      Phenix real-space refinement to identify and use that symmetry as
      "NCS" constraints (yes, NCS is a legacy term from Xtallography!).
      Aprart from this there isn't anything particular.. Alternatively,
      you can manually specify the master and symmetry related chains
      when setting up refinement job.<br>
    </p>
    <p><br>
    </p>
    <p>Pavel<br>
    </p>
    <p><br>
    </p>
    <div class="moz-cite-prefix">On 2/1/24 02:48, Dmitry Semchonok
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:AM7PR09MB3989F8F33E9A93B8009A7E81F3432@AM7PR09MB3989.eurprd09.prod.outlook.com">
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      <div class="elementToProof"
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        Dear colleagues,</div>
      <div class="elementToProof"
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        <br>
      </div>
      <div class="elementToProof"
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        Is there any specific procedure for Real space refinement in
        Phenix, having a map and model when working with helical
        structure?</div>
      <div class="elementToProof"
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        <br>
      </div>
      <div class="elementToProof"
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        Many thanks</div>
      <div class="elementToProof"
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        <br>
      </div>
      <div class="elementToProof"
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        Kind regard,</div>
      <div class="elementToProof"
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        Dmitry</div>
      <br>
    </blockquote>
  </body>
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