<p><br>
Den 24/02/2012 16.22 skrev &quot;Nathaniel Echols&quot; &lt;<a href="mailto:nechols@lbl.gov">nechols@lbl.gov</a>&gt;:<br>
&gt;<br>
&gt; On Fri, Feb 24, 2012 at 2:44 AM, Folmer Fredslund &lt;<a href="mailto:folmerf@gmail.com">folmerf@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt; &gt; If you are thinking of the maps generated by phenix.refine simply load your<br>
&gt; &gt; map in pymol, no conversion necessary.<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; In pymol:<br>
&gt; &gt; load yourmap.map, format=xplor<br>
&gt;<br>
&gt; A minor clarification: the default output format is now ccp4 format,<br>
&gt; since it&#39;s about a third the size. �You can still select X-PLOR<br>
&gt; format, of course, but I don&#39;t see any benefit to doing so unless<br>
&gt; there are programs that can handle these but not ccp4 maps. �The<br>
&gt; extension in this case is totally up to the user.<br>
&gt;</p>
<p>Dear Nat,<br>
Thanks for the clarification. If I remember correctly the Phenix.Refine manual still states that xplor is the default format? </p>
<p>Anyways, to load ccp4 style maps in Pymol, just exchange &quot;xplor&quot; with &quot;ccp4&quot; in my previous command example. (just wanted to add this fit clarity)<br></p>
<p>best regards<br>
Folmer</p>
<p>&gt; -Nat<br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; phenixbb mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
&gt; <a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
</p>