Hi,<br>I am building a model against a 2.1A data set using phenix.autobuild. Right now Rfree is about 35%. I do not want to pick water in this stage because I see denisty at N-terminal of my model which need to build more residues. However, the program still picks water even after I say &#39;place_waters=False&#39;. Does anyone know why?<br>



        <meta http-equiv="CONTENT-TYPE" content="text/html; charset=utf-8"><title></title><meta name="GENERATOR" content="OpenOffice.org 2.0  (Unix)"><meta name="AUTHOR" content="qun_wan"><meta name="CREATED" content="20090902;13161200"><meta name="CHANGEDBY" content="qun_wan"><meta name="CHANGED" content="20090906;11372200">
        
        
        
        
        
        
        <style>
        <!--
                @page { size: 8.5in 11in; margin: 0.79in }
                P { margin-bottom: 0.08in }
        -->
        </style>

<p style="margin-bottom: 0in;"><font color="#000000"><font face="Nimbus Roman No9 L, serif">phenix.autobuild data=exptl_fobs_phases_freeR_flags.mtz model=AutoBuild_run_4_/overall_best-090905a.pdb
seq_file=../ztb-sd.seq refinement.place_waters=False
refinement.refine_with_ncs=True nproc=2</font></font></p><p style="margin-bottom: 0in;"><font color="#000000"><font face="Nimbus Roman No9 L, serif"><br></font></font></p>



        <meta http-equiv="CONTENT-TYPE" content="text/html; charset=utf-8"><title></title><meta name="GENERATOR" content="OpenOffice.org 2.0  (Unix)"><meta name="AUTHOR" content="qun_wan"><meta name="CREATED" content="20090902;13161200"><meta name="CHANGEDBY" content="qun_wan"><meta name="CHANGED" content="20090906;11372200">
        
        
        
        
        
        
        <style>
        <!--
                @page { size: 8.5in 11in; margin: 0.79in }
                P { margin-bottom: 0.08in }
        -->
        </style>