<div dir="ltr">Hi ,&nbsp;<br>I am a few days into learning to use the cctbx libraries. My interests are&nbsp;mostly&nbsp;to be able to write scripts that plot various statistics from mtz files and use things like iotbx.pdb to manipulate coordinate files. &nbsp;While I have managed to write a few scripts and have read the very descriptive examples in the newsletters and the few routines inside of phenix.<div>
I have a problem with getting much out of the python interface documentation at the sourceforge site.<br><br></div><div>Say , for a particular class say&nbsp;<a href="http://cctbx.sourceforge.net/current/python/iotbx.pdb.atom_selection.html">http://cctbx.sourceforge.net/current/python/iotbx.pdb.atom_selection.html</a>,&nbsp;</div>
<div>the documentation &nbsp;gives me a &quot;cache&quot; class __init__ method that says<br><br><div>__init__(self, root, wildcard_escape_char=r&#39;\&#39;)<br><br>How do I find out what &quot;root&quot; is in this example. Should I be looking at the c++ code to find out the &quot;types&quot; of these arguments.&nbsp;</div>
<div><br></div><div>In addition a few of the auto-generated documentation pages such as &nbsp;<a href="http://cctbx.sourceforge.net/current_cvs/python/iotbx.pdb.atom.html">http://cctbx.sourceforge.net/current_cvs/python/iotbx.pdb.atom.html</a>&nbsp;</div>
<div>return an error page.&nbsp;</div><div><br></div><div>I just want to know a good way of understanding the varrious interfaces when writing code using cctbx in Python</div><div>Thanks in advance</div><div>hari<br></div><div>
<br></div></div></div>